Przy składaniu dokumentów ratyfikacyjnych, przyjęcia, przystąpienia lub zatwierdzenia następujące państwa złożyły podane poniżej deklaracje:

Królestwo Danii - z wyłączeniem terytoriów Wysp Faroe i Grenlandii.

Wspólnota Europejska - dla celów wejścia w życie Protokołu, jakikolwiek dokument złożony przez regionalną organizację współpracy gospodarczej nie powinien być uznawany za dodatkowy w stosunku do dokumentów złożonych przez Państwa Członkowskie tej organizacji (artykuł 37 ustęp 3 Protokołu).

Dokument ratyfikacyjny Wspólnoty Europejskiej złożony został ponadto z następującą deklaracją:

Wspólnota Europejska deklaruje, że zgodnie z Traktatem ustanawiającym Wspólnotę Europejską, w szczególności artykułem 175 (1), uprawniona jest do przystępowania do porozumień międzynarodowych oraz wdrażania wynikających z nich zobowiązań, przyczyniających się do osiągania następujących celów:

Ponadto Wspólnota Europejska deklaruje, że już przyjęła wiążące dla Państw Członkowskich akty prawne dotyczące spraw regulowanych Protokołem i zgodnie z artykułem 20 (3) Protokołu kartageńskiego o bezpieczeństwie biologicznym przekaże wykaz tych aktów prawnych do systemu wymiany informacji na temat bezpieczeństwa biologicznego oraz będzie go aktualizować w miarę potrzeb.

Wspólnota Europejska jest odpowiedzialna za wdrożenie tych postanowień Protokołu kartageńskiego o bezpieczeństwie biologicznym, które są również objęte obowiązującymi aktami prawa wspólnotowego.

Zakres kompetencji Wspólnoty podlega, z definicji, ciągłym zmianom.